Qu'est-ce que la bioinformatique ?
Domaine interdisciplinaire combinant la biologie, l'informatique, les mathématiques et les statistiques pour collecter, stocker, analyser et interpréter des données biologiques et génomiques
Summary
- Développe des algorithmes et des logiciels pour l'alignement de séquences, l'assemblage de génomes, la reconstruction phylogénétique, la prédiction de la structure des protéines et l'identification d'éléments fonctionnels dans les séquences biologiques de divers organismes.
- Intègre des bases de données stockant des séquences génomiques, des structures protéiques, des profils d'expression génique, des voies métaboliques et de la littérature biologique, offrant aux chercheurs un accès centralisé à des connaissances biologiques validées.
- Applique l'apprentissage automatique et des méthodes statistiques pour découvrir des tendances dans les données biologiques, prédire les fonctions des gènes, identifier des biomarqueurs de maladies et modéliser des systèmes biologiques complexes, de l'échelle moléculaire à l'échelle de l'écosystème.
La bio-informatique est un domaine d'étude qui s'appuie sur le calcul informatique pour extraire des connaissances de vastes ensembles de données biologiques.
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La bio-informatique désigne l'utilisation de l'informatique dans les biotechnologies, dans le but de stocker, extraire, organiser et analyser des données biologiques. Les projets de séquençage du génome et d'autres études produisent des quantités phénoménales de données. Face à ce déluge, la plupart des problèmes de biologie sont devenus de vrais défis informatiques. C'est Paulien Hogeweg et Ben Hesper qui ont employé le terme de bio-informatique pour la première fois en 1970. Il avait alors un autre sens qu'aujourd'hui, car son usage était lié à « l'étude des processus informatiques dans les systèmes biotiques ». Le terme a été créé au moment où les premières données de séquence biologique étaient partagées. Aujourd'hui, le terme a une acception bien plus large. Il englobe la biologie structurelle computationnelle, la biologie chimique et la biologie des systèmes (aussi bien l'intégration des données que la modélisation des systèmes). Ce domaine à forte composante interdisciplinaire mobilise les connaissances de plusieurs branches : mathématiques appliquées, informatique, statistique, intelligence artificielle, chimie et biochimie. La bio-informatique joue un rôle indispensable dans la gestion des données en biologie et en médecine modernes. Ce domaine passionnant de la science a de nombreuses applications et de vastes champs de recherche, dont voici les plus connus :
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- Analyse de séquence
- Prédiction de la structure des protéines
- Annotation du génome
- Génomique comparée
- Santé et découverte de médicaments
- Nettoyage des déchets
- Biotechnologie
