Qu'est-ce que la génomique ?
L'étude des génomes — séquençage, assemblage, annotation et analyse de l'ADN — permet de comprendre la variation génétique, l'évolution, les mécanismes des maladies et la biologie.
Summary
- Englobe le séquençage du génome entier, la génomique comparative interspécifique, la génomique fonctionnelle (étude de l'expression et de la régulation des gènes) et la génomique des populations (analyse de la variation génétique et des schémas évolutifs au sein et entre les populations).
- Permet l'identification des mutations responsables de maladies, le développement de thérapies ciblées, la compréhension des réponses aux médicaments grâce à la pharmacogénomique et l'étude de l'adaptation des organismes et de la biodiversité grâce à des analyses évolutives.
- Nécessite des outils informatiques pour l'alignement des séquences, la prédiction des gènes, l'identification des variants, l'analyse des voies métaboliques et l'intégration des données multi-omiques (transcriptomique, protéomique et métabolomique) pour une compréhension biologique globale.
La génomique est un domaine de la génétique qui s'intéresse au séquençage et à l'analyse du génome d'un organisme. Sa mission principale est d'établir la séquence complète d'une chaîne d'ADN ou la composition des atomes qui composent l'ADN, ainsi que les liaisons chimiques qui les unissent. La génomique étudie le génome en tant que structure. On peut donc la considérer comme l'étude du matériel génétique complet d'un organisme. Bien que l'ADN ait été isolé pour la première fois en 1869, la génomique n'a vu le jour que dans les années 1970, lorsque les scientifiques ont découvert que l'ADN était une séquence de composants simples. La plus grande percée de la génomique a eu lieu en 1995, quand le séquençage de l'intégralité d'un organisme vivant autonome, le virus Haemophilus influenza, a été réalisé. Le projet Génome humain a été lancé en 1990 dans le but de séquencer les 3 milliards de lettres qui composent notre génome. Le chromosome 22 a été le premier à être séquencé dans le cadre de ce projet, en 1999. Le Consortium international pour le séquençage du génome humain a publié la première ébauche du génome humain dans la revue Nature en février 2001. La séquence de l'intégralité des trois milliards de paires de bases du génome était alors achevée à 90 %. La séquence complète a été terminée et publiée en avril 2003. La génomique évolue en permanence et elle recouvre plusieurs domaines de recherche clés :
- Bioinformatique : ce domaine interdisciplinaire utilise des ordinateurs, des outils logiciels et des bases de données pour extraire, analyser et interpréter de grandes quantités d'informations biologiques.
- Protéomique : ce champ d'étude complexe se concentre sur l'évolution des motifs d'expression des protéines en fonction des conditions pathologiques et environnementales.
- Génomique structurelle : cette partie de la génomique consiste à caractériser les structures du génome.
- Génomique humaine : comme son nom l'indique, la génomique humaine se concentre sur l'étude de la séquence du génome humain.
- Génomique des bactériophages : désigne l'étude du génome des bactériophages et des virus qui infectent les bactéries. Ce périmètre de l'étude a pour objectif de trouver un traitement alternatif aux maladies causées par une bactérie résistante aux antibiotiques.
- Métagénomique : se concentre sur l'étude des métagénomes ou du matériel génétique obtenu à partir d'échantillons environnementaux.
- Génomique des cyanobactéries : cette branche de la génomique étudie les cyanobactéries, une famille de bactéries qui tire son énergie de la photosynthèse.
- Pharmacogénomique : ce domaine de la recherche en génomique s'intéresse à l'impact des variations génétiques sur l'efficacité et la toxicité d'un médicament
